Để đảm bảo thực khối lượng công việc, nhiệm vụ được giao, Trung tâm Đo lường tổ chức biên chế gồm có Ban Giám đốc để điều hành chung và 05 phòng chuyên môn, với trên 20 kiểm định viên, thử nghiệm viên, chức năng cụ thể như sau:

• Phòng Quản lý chất lượng & Nghiên cứu phát triển: Có chức năng quản lý hệ thống chất lượng, lập kế hoạch, quản lý hành chính, tài chính và công tác nghiên cứu, phát triển của Trung tâm.
• Phòng Chiều dài và Quang học: Thực kiện công việc chuyên môn đo lường, thử nghiệm trong lĩnh vực độ dài, đo kiểm hình dáng, kích thước hình học và các chỉ tiêu ánh sáng, quang học.
• Phòng Lực & Cơ lý tính vật liệu: Thực hiện công việc chuyên môn đo lường, thử nghiệm trong lĩnh vực lực, mô men, phân tích các chỉ tiêu cơ lý tính, độ bền, tổ chức cấu trúc vật liệu và kiểm tra không phá huỷ.
• Phòng Khối lượng & Hoá phân tích: Thực hiện công việc chuyên môn đo lường, thử nghiệm trong lĩnh vực khối lượng, dung tích, phân tích thành phần hoá học.
• Phòng Nhiệt – Điện – Áp suất: Thực hiện công việc chuyên môn đo lường, thử nghiệm trong lĩnh vực nhiệt độ, độ ẩm, điện, điện tử, áp suất và thử nghiệm môi trường.